V Nacionalnem laboratoriju za zdravje, okolje in hrano (NLZOH) so v sodelovanju s KISLD UKC Ljubljana od 1. 1. 2021 do 29. 8. 2021 s sekvenciranjem zaporedij celotnih genomov analizirali 13.431 vzorcev, od tega je bilo 1.846 genomov sekvenciranih v sodelovanju z ECDC. Od vseh sekvenciranih je 13.226 vzorcev iz leta 2021.
V zadnjem obdobju, od 23. 8. do 29. 8. 2021, so uspešno posekvencirali 384 vzorcev, 320 vzorcev iz sheme A (50 % pozitivnih vzorcev), 10 vzorcev iz sheme B (vzorci, ki niso vključeni v shemo A in na podlagi presejalnega testa niso pripadali delta različici) in 54 vzorcev iz sheme C (naročilo epidemiologov).
Med 320 vzorci iz sheme A so potrdili samo delta različico virusa SARS-CoV-2 (B.1.617.2 ter njene pod-linije AY.4 do AY.14; n=320; 100 %)
Med 13.226 vzorci iz leta 2021 (iz vseh shem) so v NLZOH zaznali 78 različic virusa SARS-CoV-2.
Skupaj z Inštitutom za mikrobiologijo in imunologijo medicinske fakultete Univerze v Ljubljani so do sedaj v Sloveniji potrdili 5367 primerov različice delta in 11 primerov različice delta plus, 10.800 primerov različice alfa, 29 primerov različice beta in devet primerov različice gama. Različico eta so potrdili v 48 primerih, različico jota v sedmih primerih in različico B.1.1.318 v 19 primerih.
Različica delta je bolj nalezljiva kot ostale različice, zato tudi v nacionalnem laboratoriju pozivajo vse prebivalce, ki še niso polno cepljeni, naj se cepijo čim prej, saj polno cepljeni razvijejo visoko zaščito tudi proti tej različici.
Sledenje različicam novega koronavirusa v Sloveniji izvajajo v NLZOH v sodelovanju s kliničnim inštitutom za specialno laboratorijsko diagnostiko pediatrične klinike Univerzitetnega kliničnega centra Ljubljana ter na Inštitutu za mikrobiologijo in imunologijo (IMI) medicinske fakultete Univerze v Ljubljani.